„Cookie” to mały plik z informacjami zachowanymi przez witrynę internetową. Pliki cookie przechowywane są na dysku komputera. Zwykle są one pożyteczne i nie sprawiają problemów. Bardzo rzadko zdarza się napotkać zły plik cookie.
Przy otwarciu witryny wymagającej użycia plików cookie, zgłasza ona Safari konieczność zachowania takiego pliku na dysku. Po ponownym otwarciu tej samej strony, Safari wysyła należący do niej zachowany plik cookie. Pliki cookie pozwalają witrynie zidentyfikować odwiedzającego, dzięki czemu może ona wyświetlić odpowiednie informacje przeznaczone dla danego użytkownika.
W plikach cookie mogą być przechowywane informacje identyfikujące użytkownika, takie jak imię czy adres e-mail. Witryna ma dostęp tylko do informacji podanych przez użytkownika. Przykładowo, witryna nie może poznać adresu e-mail użytkownika, jeżeli ten jej go nie poda. Inne informacje zawarte na komputerze nie są dostępne dla stron internetowych.
Domyślnie Safari automatycznie przyjmuje i wysyła pliki cookie odpowiednim witrynom.
Można zmienić ustawienia preferencji plików cookie, tak aby Safari w ogóle ich nie przyjmowało, lub przyjmowało tylko z niektórych źródeł.